资源大省云南在推进新型工业化发展过程中面临三方面的突出问题。 

    一是工业内部结构不合理，主要表现在三方面：首先是产业结构不合理。烟草产业"一支独大"的局面仍将继续，资源型加工产业仍占主导地位，新型工业和高新技术产业发展缓慢，整体实力弱，尚未形成支撑工业发展的主导力量。另外是企业组织结构不合理。云南真正的大企业、大集团不多，能进入全国500强的少，生产企业规模小、科技开发分散、人才分散，竞争力较弱。大型国有及国有控股企业比重仍占主导地位，约占65%，非公经济、中小企业、乡镇企业的发展与发达地区差距较大，在全省经济总量中所占比重低。最后是地区结构不合理，产业结构趋同，16个州市中有8个州市把烟草作为重点产业；13个州市把能源和电力作为重点产业。

    二是经济增长方式落后。长期以来，云南省都是"高投入、高消耗、高排放、低效率"的增长方式。 以云南的支柱产业之一矿业为例，磷化工长期处在大量出售矿石及初级产品的阶段，深加工和高附加值的精细磷化工产业发展刚刚起步；有色金属大部分产品停留在金属锭状态，高技术含量、高附加值产品少，能源消耗高，环境代价高，经济效益低。其材料加工产量仅占总产量的15%左右，且多为初级产品。

    三是资源和资金等"瓶颈"制约仍未得到根本缓解。工业企业用电量增长较快，枯期缺电局面仍未改变，煤炭供应中烟煤总体偏紧，无烟煤结构性过剩，原材料价格持续上涨等将成为制约冶金、化工等重工业规模化和快速发展的瓶颈。